1. Nie powinno się używać ExecutorService'ów w pluginach do minecrafta. Po to Bukkit ma własny ExecutorService aby właśnie z niego korzystać (i m.in poprawnie finalizować taski etc. przy wyłączaniu pluginu)
2. Jeśli już już chcesz używać własnego ExecutorService'u to pamiętaj, aby przy wyłączaniu pluginu (tj. w onDisable) użyć metody shutdown na nim
3. Nie, nie spowoduje. ExecutorService (ani ogólnie wątki w javie) nie używają fizycznych wątków procesora tylko tzw. wątków systemowych. Nie wiem jakiego systemu używasz ale w przypadku windowsa możesz wejść w Menedżer zadań -> Wydajność -> CPU i na dole w informacjach będziesz miał coś takiego:
To jest właśnie liczba tych wątków systemowych. To już system sam sobie pod spodem rozdziela to pomiędzy fizyczne wątki procesora