Tak można do zablokowania komendy użyć skryptu:
on command "/komenda":
if player does not have permission "tutaj.permisja":
cancel event
send "Nie masz uprawnień do użycia tej komendy!" to player
Co do 2 pytanie był kiedyś plugin CommandOverride ale działał on do wersji max. 1.14 alternatywy nie znam może ktoś inny ci doradzi